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    基因测序技术再迎新升级!NCM大会发布新一代测序仪 P2

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      来源:延安市某某机床铸造维修站  更新时间:2025-07-10 20:48:49  【打印此页】  【关闭】

    基因测序技术再迎新升级!基因技术级NCM大会发布新一代测序仪 P2

    2021-12-13 09:53 · 生物探索

    Oxford Nanopore开发的测序测序是新一代的传感技术,使用嵌入高科技电子设备中的再迎纳米孔进行精确的分子分析。为用户提供高准确度、新升新代高通量、发布信息丰富、基因技术级多样化的测序测序平台设备。

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    Oxford Nanopore开发的再迎是新一代的传感技术,使用嵌入高科技电子设备中的新升新代纳米孔进行精确的分子分析。为用户提供高准确度、发布高通量、基因技术级信息丰富、测序测序多样化的再迎平台设备。

    从便携性到超高通量的新升新代测序平台,Oxford Nanopore为用户的发布不同应用需求提供了灵活多样的选项。我们将继续扩展测序平台,并推出 PromethION 2 及 PromethION 2 Solo 测序设备,搭配不断升级优化的芯片设计,使高通量纳米孔测序更加可及。

    PromethION 2

    ◾ 具备集成计算功能的独立设备

    ◾ 搭载强大的GPU处理器,及显示屏

    ◾ 可运行最多两张高通量 PromethION 测序芯片

    ◾配置完善,即插即用

    ◾ 计划将于2022年第三季度发货,请访问以下网站注册您的意向:

    https://store.nanoporetech.net/p2-sp.html

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    PromethION 2 Solo

    ◾ 可连接至现有计算设备(包括 GridION)的测序模块

    ◾ 可运行最多两张高通量 PromethION 测序芯片

    ◾ 体积小巧,对基础设施要求及低

    ◾ 计划将于2022年第二季度发货,请访问以下网站注册您的意向:

    https://store.nanoporetech.net/p2-solo-1.html

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    我们也将推出一系列纳米孔及化学试剂的升级更新,为用户提供高准确度、高通量、信息丰富的测序数据,及更加灵活的选项来达到期望的通量及实验效果。

    未来我们将在已有的试剂盒10系列(Kit10)基础上,优化文库的捕获效率,及反应体系能量使用效率,以降低文库投入量同时提高文库产出。并同时推出全新的试剂盒12系列为用户提供更高准确度的测序数据。

    试剂盒11系列(Kit 11)将沿用现有的马达蛋白,提供约420bp/s的过孔速度,以支持对通量有较高需求的应用。

    试剂盒12系列(Kit 12)将使用新的Q20+化学试剂中的马达蛋白,提供约250bp/s的过孔速度。与R10.4纳米孔搭配使用,试剂盒12系列可提供>99%的单分子准确率,并支持双链(duplex)测序以达到接近99.9%的单分子准确率。

    配合以上试剂盒的升级,我们也将相应对测序仪硬件、软件、碱基识别算法,及芯片通量进行优化及升级。

    更多最新试剂盒相关信息,请参见:

    https://store.nanoporetech.net/sample-prep.html

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     Oxford Nanopore致力于使任何人、在任何地方、可以分析任何生物。我们在科技的前沿不断探索、突破,不仅为用户带来不断攀升的准确率,更为用户带来了前所未有的使用感受及丰富功能。无需复杂样本处理的靶向测序;直接读取、实时检测的碱基修饰信息;从短片段到超长片段的精确读取。依托最新技术提升产品功能;攻坚新型ASIC集成电路;开发一体化液体活检平台。下文中,我们将为大家详细梳理即将推出的新产品及研发管线中产品的最新进展。

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    芯片更新

    PromethION “Marathon” 芯片 (M芯片,耐久性马拉松芯片)

    升级的PromethION M芯片可储存更多的测序介质,支持芯片更长的稳定运行时间。同等有效纳米孔数目的PromethION M芯片可提供更大的产出。该芯片预计于2022年一季度进入早期用户试用阶段。

    我们也将对PromethION P24/P48的计算模块中的GPU及其他硬件进行升级,以支持不断提升的数据产出。新的计算模块预计于2022年二季度开始发售,我们也将为已有用户提供升级计划。

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    图例:PromethION M芯片可支持更长的稳定运行时间,并提供更大的单位产出。

    试剂盒更新

    混样连接测序试剂盒 (Multiplex Ligation Kit,SQK-MLK111.96-XL)

    早期试用阶段

    该试剂盒为试剂盒11系列(Kit 11),集成了连接测序试剂盒XL与96个非扩增条码,意在支持每张 PromethION 测序芯片可提供交付两个人类基因组(每个基因组20-30X测序深度)。一台PromethION P48最高可支持192基因组/周,或约1万基因组/年的测序通量。

    目前已开发基于Hamilton工作站的自动化建库解决方案,可支持2个基因组的混样建库操作。

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    超长DNA片段测序试剂盒 (Ultra-long Sequencing Kit)

    该试剂盒搭配NEB Monarch® 高分子量DNA提取方案,可实现超长读长片段的DNA测序—N50>100kb, 最长片段超过Mb。目前该方案支持对细胞、血液、及冷冻组织样本进行高分子量DNA的提取及测序。

    我们预期于2022年一季度推出基于社区方案开发的短片段筛选试剂盒。

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     cDNA-PCR 测序试剂盒 (cDNA-PCR Sequencing Kit)

    更新的cDNA-PCR测序试剂盒(SQK-PCS111,试剂盒11系列)包含高捕获、高能效测序接头,可提供更高的全长转录本测序产出—PromethION 单张芯片产出 >160 M reads,MinION 单张芯片产出 >20 M reads。

    除此之外,我们还对试剂盒内的反转录接头及反转录引物进行了优化,使其在转录本的末端开始进行cDNA合成反应,以支持准确的polyA尾长度分析。新的建库流程中还加入了UMI,以更好的提高全长转录本定量分析准确性。

    我们也同时推出了cDNA-PCR混样测序试剂盒(SQK-PCB111.12),可支持高达12个样本的混样建库操作。

    该试剂盒还简化了单细胞转录组的分析,能够为异构体挖掘/鉴定、融合转录本、细胞亚型分析或空间分析提供全长读长序列。我们目前正在开发基于纳米孔测序的单细胞全长转录组的实验及分析解决方案。

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    软件更新

    自适应采样(Adaptive Sampling)

    自适应采样是 Oxford Nanopore 测序平台上一个独特的功能,支持实时选择感兴趣的 DNA 目标区域,而不需要额外的样本前处理操作。我们即将在MinKNOW中推出简化甲基化测序功能。从单次 MinION 芯片运行中获得 600 万个 CpG 位点甲基化信息,代表着优于亚硫酸氢盐方法的性能,且保留了简单的工作流程、低成本和快速获得结果等的纳米孔测序技术优势。

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    短片段模式 (Short Fragment Mode)

    Oxford Nanopore 的技术可以对任何长度的 DNA 或 RNA 分子进行测序,无论是短序列还是超长序列。然而软件输出设置在过去避开了读取较短的“仅为测序接头”的序列。SFM 旨在优化需要以高精度分析大量短片段的应用,在一张 PromethION 测序芯片上,可支持多达 2 亿 5 千万条长约 200bp 的人类原始读长序列。

    该功能目前为开发者试用阶段,预计在新的一年里全面启用。

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    产品/研发管线更新

    MinION Mk1D

    我们正在开发一种集成的平板电脑型测序仪 MinION Mk1D。随着消费级平板电脑的处理能力不断升级,我们可以利用其搭载的最新处理器,更高效的处理 MinION 生成的大量数据。并同时利用其他功能,例如5G连接,随机续航时间等。

    您可以通过以下链接注册MinION Mk1D的早期访问计划:

    https://nanoporetech.com/products/minion-mk1d

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    液体活检平台

    为实现易于使用的远程“液体活检”测序,我们在探索集样本制备、测序、分析与一体的液体活检平台。

    该产品概念基于已有的芯片技术,在纳米孔上方加装一个样本处理元件。该样本处理元件可对原始样本进行处理,处理后的样本通过电泳移动到下方纳米孔,并被测序。这一概念不仅适用于核酸分子,也可扩展应用于其他小分子或代谢产物的感应分析。

    该平台仍处于研发的早期阶段,通过下图的研发原型机,我们已经获得了从样本到测序数据的概念验证。

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    低成本Flongle芯片

    Flongle 是一款低成本的测序芯片,与Flongle适配器搭配可适用于MinION及GridION测序仪。为用户提供快速、可及的低通量测序选项。

    针对Flongle 开发的低成本测序芯片方面取得了新的进展。在每张芯片 120 个纳米孔的概念验证中,已在其上生成了 2 Gb 数据。该设计现在正在进入原型制造阶段。

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    新一代ASIC

    ASIC作为纳米孔芯片和设备的引擎,一直是我们研发优化的重点。硅基芯片在工作中需要消耗一定的功耗,并需要持续散热。我们一直在开发一种全新的、非硅基芯片,具有更低功耗和低噪音设计。该芯片旨在推动新产品的开发,如手机 SmidgION 测序仪或 Plongle 桌面“阵列”测序仪。我们已经在实验电路板上使用该新型ASIC获得了初步的测序数据。

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    产品阶段说明

    在Oxford Nanopore, 我们致力于令用户更快的使用最新的产品及技术,并结合用户的反馈迅速动态优化产品。下表中列举了Oxford Nanopore产品的不同阶段及产品支持细节:

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    *Oxford Nanopore Technologies 产品并非旨在用于健康评估或诊断、治疗、缓解、治愈或预防任何疾病或状况。

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